brmScope
brmScope cheap digital microscope |
|
founder: | tomsuch |
depends on: | |
interested: | RAINBOF
stick
pasky |
software license: | |
hardware license: | |
brmscope is a webcam-microscope mounted on a 3-axis micromanipulator controlled with stepper motors.
Projekt brmScope si klade za cíl vytvořit digitální mikroskop s použitím co nejlépe dostupných komponent.
Status
V tuto chvíli máme sestavený funkční (doslova drátěný) model s funkčním softwarem na ovládání, jednoduché snímkování a drobné hw korekce v obrazu, ovládání joystickem. vyzkoušeli jsme si prohlédnout jednoduché polovodiče, integrované obvody, pár biologických vzorků (krvinky) a můžeme konstatovat že projekt je funkčním modelem.
Návod k použití
Brmscope najdete v biolabu, připojený k počítači Hind3. Na stěně je návod k použití. Je třeba zapojit do USB joystick, webcam i Arduino.
Ovládací software spustíte přes ikonku na ploše 'brmscope', je trochu komplikovaný. V zásadě klikněte v pořadí na tlačítka CONNECT, ODBRZDIT, START, JOY START. Pak by měl začít joystick fungovat. Občas fungovat přestane (nebo se velmi zmenší délka kroku), v tom případě zmáčkněte STOP a pak zase START.
Na obraz se dívejte třeba přes program cheese (fullscreen F11).
Posun po ose Y (zaostřování) ovládají tlačítka vlevo/vpravo na hlavě joysticku. Obstarává jej svislá tyčka omotaná izolepou, která má tendenci se zasekávat, pak je jejímu otáčení třeba pomoci rukou.
Nahrávání
Snímek obrazu:
$ mplayer -frames 1 -vo png tv:// -tv device=/dev/video1
Snímek má lehce pod 1 MB.
2015: pro nahrávání se doporučuje použít program cheese
Nahrávání s GStreamerem - vidíte, co nahráváte :)
vysílání a zobrazování
$ gst-launch v4l2src device=/dev/video0 ! video/x-raw-yuv,width=640,height=480 ! \
videorate ! video/x-raw-yuv,framerate=15/1 ! ffmpegcolorspace ! tee name=a a. ! \
ffenc_mpeg2video pass=quant quantizer=4 ! mpegtsmux ! \
tcpserversink host=localhost port=5000 a. ! queue ! xvimagesink
Kvantizér si nastavte tak, aby to váš počítač stíhal (vyšší kvantizace - horší kvalita). Notebook s Intel Atom stíhá 2-4.
zachytávání
$ gst-launch tcpclientsrc host=localhost port=5000 ! filesink location=out.mpg
Záznam má řádově 1 GB/hodina
Software
BrmScope
Aktuální software napsal TomSuch (a rainbof?) v Gambasu. Odlaďovalo se na něm veškeré ovládání, takže výsledné rozhraní je poněkud neintuitivní. Zdrojáky: http://github.com/brmlab/brmscope
GitHub, last commits
MicroView
GitHub, last commits
Hardware
V této chvílí máme k dispozici běžně prodávaný usb mikroskop s přiblížením 400x a 2mpix vga kamerou kompatibilní s rozhraním Video4linux.
Kamera je pohyblivá ve třech osách XYZ pomocí mikroposuvu (precision slide). Trochu zvláštností je že se tedy hýbe se mikroskop nikoliv vzorek/preparát. Osa Y slouží k ostření obrazu.
Osy mikroskopu jsou napojeny na krokové motory a ty dál ovládány pomocí Arduina. Firmware na: http://github.com/brmlab/brmscope
Todo
Hardware
opravit zadrhávající se posun po ose Y
vylepšit stabilitu obrazu při posunu
lepší optika, dosáhnout zvětšení 800
kamera s větším rozlišením
většina věci tisknutelných na RepRapu
náhrada mikroposuvu za něco dostupnějšího
lepší podsvícení zespodu
Software
snadno použitelné rozhraní
software integrující ovládání i zobrazování
nahrávání záznamu obrazu (zatím máme jen snímkování)
automatické ostření
automatické vyhledání vzorku
definovat licenci (gpl2?)
automatické nasnímání velkého vzorku a sestavení do jednoho velkého panorama
First panorama
autopano-sift-c --projection 0,10 project.pto *.ppm
autooptimiser -a -l -s -o project.pto project.pto
nona -m TIFF_m -o project project.pto
enblend -o project.png project*.tif
Result:
TODO: area, not only one line
Pics or it didn't happen!
Links