~~NOTOC~~

====== Základy molekulární biologie ======

{{template>infobox|
image=http://jenda.hrach.eu/brm/molbio/leaflet.png|
name=Základy molekulární biologie|
organizer=Jenda|
interested=[[user:Chido]]|
datetime=8.4.2011 18:00|
place=brmlab}}

Příchozí se pokusím seznámit se základy molekulární a buněčné biologie. Nejdřív v rychlosti zopakujeme buněčnou teorii a pak se budeme věnovat proteosyntéze a všemu, co s ní souvisí (struktuře DNA, genetickému kódu, replikaci atd.). Další část bude věnována dnes tak módním biotechnologiím - dozvíte se, jak se sekvenuje DNA, co to vlastně jsou geneticky modifikované organizmy a jaké jsou možnosti aplikace poznatků genetiky při léčbě různých chorob. Na konci se doufám rozproudí ontopic i offtopic diskuze, ze které třeba vzejdou náměty na další přednášku.

Přednáší Jenda pod dozorem Chido, která mě zarazí, kdybych začal říkat nějaké moc velké nesmysly :).

Osnova (ještě se může trochu měnit):

  * brmlab, aneb kam jste se to vlastně dostali
  * buňka, buněčná teorie, jedno/mnohobuněčné organizmy, diferenciace buněk
    * → obrázek
    * CPM, jaderná membrána (karyolema)
    * organely - mitochondrie, cytoskelet, ribozomy, EPR, chloroplasty, vakuoly
    * JÁDRO - bez pravého jádra (prokarya), eukarya, buňky s více jádry
    * bílkoviny, aminokyseliny, enzymy (→obrázek) jako biokatalyzátory
      * → proteosyntéza
  * jádro
    * chromozomy - kruhové (prokarya), eukarya - stavba; centromera, chromatida
    * chromatin, histony
    * DNA
  * DNA
    * struktura 
      * ribóza
      * PO_4^3-, objev AsO_4^3- (http://www.osel.cz/index.php?clanek=5416)
      * nalepené báze (třičko, obrázek)
      * jednotka = nukleotid
      * de/renaturace DNA
    * báze, komplementarita
    * genetický kód, triplet~kodon
    * RNA, mRNA (→obrázek transkripce)
    * genová exprese, proteosyntéza - ribozomy, centrální dogma molekulové genetiky
      * DNA → RNA → protein
  * buněčný cyklus, replikace
  * poškození DNA
    * mutageny, teratogeny (thalidomid), inozující záření
    * chromozomové aberace
    * záměna nukleotidu - bodové mutace
    * inzerce/delece, frameshift, předčasný stop kodon, význam více stopkodonů a degenerace kódu
    * význam mutací v evoluci
  * nic není tak jednoduché, jak vypadá
    * methylace DNA
    * introny (nekódující úseky), mRNA splicing u eukaryí
  * černá magie
    * plazmidy
    * indukované náhodné mutace (1930~1990)
    * GM ve službách člověku i proti němu
      * lidský inzulin a proteosyntéza obecně
      * GMO princip
        * kytky
          * vitamíny (Golden rice)
          * odolnosti
            * produkce vlastních toxinů
            * rezistence k totálním herbicidům
        * pokusná zvířata
          * výzkum, octomilky, fluorescence, indukce vad
        * in-the-wild
          * sterilizace komárů
      * a obavy
        * z neznámého (anebo kdo ví, vo co go → tahle přednáška :)
          * irracionální
            * rajče + ryba = žábry, biohovězí ?= bučení - „slabší vazba“
              * nukleázy ve střevech
            * alergeny
        * proti konkrétním implementacím - superplevel
        * geoingeneering - a co šlechtitelství (pšenice, kukuřice)?
      * GM ve službách člověku *i proti němu*
        * biologické zbraně
  * fun with DNA
    * termíny: ATP, palindrom, restrikční endonukleáza, elektroforéza
    * extrakce DNA (→obrázek homemade extrakce)
    * čtení~sekvenování
      * prťavé → nepřímé metody
      * „klasické“ - elektroforéza
        * růst různě velkých částí
          * omezení: Maxam-Gilbert, Sanger
        * část imezená restrikčními endonukleázami
          * (víc → opět lze elf odseparovat) ~1 kb
        * no a pak elf. a analýza - fluorescenčně, radioaktivní poznačení
      * „výstřelky“
        * pyrosequencing
        * tahání vlákna mezi pikoelektrodami
      * člověk ~3 Gb → masivní paralelizmus, překryv
        * bioinformatika
        * stáhněte si skutečný virus (bakteriofág), tučňáci - jen 5,4 kb! :-P
          * http://www.promega.com/vectors/phix174.txt
  * ke vzniku rakoviny
    * telomeráza, mutageneze
    * aktuálně: jódová profylaxe, LNT model
    * LNT (bez/prahové působení)
  * viry a retroviry
    * reverzní transkriptáza, riziko rakoviny
  * genové terapie
    * mRNA interference
    * dodání programu pro syntézu produktu
      * bublinové děti
      * vektor retrovirus, rizika viz výše
  * zbyl čas?
    * priony, CJD/BSE
    * současná léčba rakoviny
    * jak funguje disulfuram
    * diskuze ontopic i offtopic (brmlabí projekty, IT, elektronika, chemie, fyzika…)
  UAA/UAG/UGA/EOF/BRM

recordings: http://nat.brmlab.cz/talks/molbio.mkv http://nat.brmlab.cz/talks/molbio2.mkv
{{tag>video}}