====== BrMicroscopy ====== {{template>project:infobox| name=BrMicroscopy| image=icon_microscope.jpg?128| founder=[[brmlab]]| depends on=time| interested= [[user:sumie-dh]]\\ [[user:pinky]]| status=in progress}} Brmlab disponuje nekolika mikroskopy s ruznym uplatneni a mirou kvality. Mikroskopovaci stul najdete v rohu biolabu, nelze ho prehlednou vzhledem ke koncentraci mikroskopu na nem ;] Pracoviste je vhodne na pozorovani z terenu donesenych biologickych vzorku [prvoci, rasy, rozsivky, bakterie, drobni zivocichove], zivych bunek, mineralogie, konstrukce a struktury plosnych spoju nebo chipu a urcovani druhu hmyzu. Chod pristroju obstaravaji [[:user:sumie-dh|sumie-dh]]. ===== Obecna pripomenuti ===== Par drobnosti ktere se hodi vedet nez sednete k mikroskopu: **//Optika je citliva a krehka// ** Pokud je nekde neco zadrhnute, nejde to nasadit, otacet , pravdepodobne je to ucel. Opticke zalezitosti jsou konstruovany tak aby se nasili nemuselo vubec pouzit. Pouzivanim principu "co nejde silou, pujde jeste vetsi silou" nema u optiky co delat. Znicite-li neco timto zpusobem, pravdepodobne o vas bude pozadovana nahrada , viz dalsi bod. **//Pokud neco rozbiji, je slusnosti to ohlasit// ** Nehody se stavaji. Pokud se tak stane, ohlaste skodu [[:user:sumie-dh|sumie-dh]]. Pocitejte s tim ze optika je pomerne draha a nahrada skody se muze pohybovat v rozsahu tisicu Kc. **//Pozorovatel po sobe uklizi// ** Rezervujte si dostatek casu na uklid pracoviste, omyti laboratorniho skla a navraceni predmetu na sve misto, procedura muze zabrat cca 15 min. Vracejte vse tam kde jste to vzali. Mikroskopovaci stul se po praci desinfikuje 70% roztokem EtOH, ktery najdete ve stricce v prislusnym popisem a setre se do sucha. ---- ===== Udrzba ===== Idealni stav mikroskopu po vasem pozorovani je takovy ze dalsi pozorovatel nepozna ze jste s nim pracovali. Navratte pristroj do stavu v jakem byl pred vasi navstevou, zejmena u Makroskopu tak odpadaji nadavky a zdlouhava procedura vedouci k debugovani zdanlive nefunkcnich casti. == Imerzni objektivy [ty se 100x zvetsenim] == Imerzni objektivy vyzaduji ponoreni spicky objektivu do imerzniho oleje. Po skonceni pozorovani je nutne ocistit objektiv od zbytku oleje. Zasychani oleje vede k poskozovani objektivu a zkracovani jeho zivotnosti. == Stolky mikroskopu == Po kazdem pozorovani omejte stolek mikroskopu navlhcenym [vodou, pripadne etohem] hadrikem / papirovym ubrouskem. == Trinokularni tubusy, tubusy okularu == Zavirat, zakryvat, po nasypani bince dovnitr vycistit! Muze se stat ze dalsimu pozorovateli ktery prijde po vas toto opomenuti znici fotografie / video pritomnosti castecek prachu na cockach uvnitr tubusu. === Pozorovani specifickych objektu === == Zive subjekty == Meli jsme v biolabu nekolik pripadu pozorovani zivych tvoru vyssiho radu. Tudiz se hodi pripomenout par veci tykajici se zivych potvor: * 10 z 10 subjektu nesouhlasi s fixaci, manipulaci a obecnym obtezovanim jejich bezneho fungovani, zkracujete dobu pozorovani na dobu nezbytne nutnou * pokud pozorujete s prisvitem, pocitejte s tim ze prisvit generuje teplo [markantni zejmena u halogenu stereoskopickeho mikroskopu], jehoz dlouhodobe pusobeni muze vest az k uhynu subjektu. — ===== Mikroskopy ===== V biolabu bydli 4 kusy volne dostupnych mikroskopu. U makroskopu by jsme nicmene radi kdyby se zajemce nechal zaucit. ==== Nephot 32 aka Macroscope ==== vhodný pro: mikroskopie v odrazenem svetle - povrchy kovů, mincí, struktura chipu a spoju, mineralogie \\ objektivy: planachromaticke 1,25, 3.2x, 6.3x, 12.5x, 25x, 50x, 100x [imerzni] vsechny s moznosti dodatecneho zvetseni 8x, 10x, 12.5x, 16x, 20x \\ okulary: 10x \\ owner: brmlab |[[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=b9d630&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/makroskop.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/makroskop.jpg?direct&500 }}]]|1 - promitaci deska \\ 2 - okulary \\ 3 - velkoformatova kamera \\ 4 - jemne ostreni \\ 5 - dodatecne zvetseni \\ 6 - nastaveni outputu \\ 7 - vystup do zdcadlovky \\ 8 - hrube ostreni [vhodne pro male zvetseni] \\ 9 - polarizacni clona \\ 10 -objektivy \\ 11 - stolek \\ 12 - fixace vzorku vertikalni \\ 13 - vymenne podlozky pod vzorek - viz prvni suplik \\ 14 - polarizacni filtr \\ 15 - darkfield \\ 16 - clona \\ 17 - barevne filtry \\ 18 - ovladani xenonove lampy - nesahat! \\ 19 - ovladani xenonove lampy - nesahat! \\ 20 - operky \\ 21 - tyce stolek nahoru \\ 22 - ovladani modu xenonove lampy - nesahat!| Invertovany svetelny mikroskop puvodne pouzivany pro metalurgicke zalezitosti. Aktualne nejlepsi opticky kus a nejslozitejsi mikroskop v celem brmlabu. Jeho maximalni opticke zvetseni muze dosahnout hodnot az 2000x. Stolek muze nest az 2kg tezky vzorek [v dokumentaci je zminen dokonce vzorek do 5kg]. Pred pozorovanim je vhodne chytit si zkusenejsiho uzivatele a nechat si ukazat ovladani pristroje a par dalsich uzitecnych triku. V dnesni dobe se jedna spise o starsi kus. Z tohoto duvodu k Makroskopu prostupujte s nejvyssi opatrnosti, sehnat nahradni dily bude obtizne ne-li primo nemozne. Pokud to bude mozne, ocekava se ze to bude drahe [das ist Carl Zeiss Jena , echt Gold Microscope!]. To znamena: Nezasahujte do instalace a konstrukce pristroje! Makroskop je slozita masina netrivialni stavby s komplikovanou osobnosti. Navic ho mame radi! Pro tezke vzorky vyzivejte kovove podlozky, ktere najdete v prvnim supliku makroskopovaciho stolu. Sklenene se snadno poskrabou a mohou praskat. Dostupne moznosti pozorovani objektu: * bright field * polarizovace v odrazenem svetle * darkfield Vsechny typy pozorovani je mozno kombinovat s ruznou urovni zacloneni. Ugly hacks: * polarizovace prusvitova [ongoing development] * fluorescencni mikroskopie [LED + filtry] U vsech typu pozorovani je mozno presmerovat output do: * promitaci deska [stinitko se scintilatorem] [symbol <] * zrcadlovka + realtime vystup na monitor biolabiho pocitace [symbol V] * okulary mikroskopu [symbol oka] * pristrojovy vystup [symbol >], aktualne se vubec nepouziva, nebot nemame casti potrebne k visualizaci vystupu Typy pozorovani nelze vzajemne kombinovat, pokud chcete zaroven fotit a zaroven koukat, je nejlepsi volbou zobrazeni realtime outputu zrcadlovky na monitoru. == Osvětlení == Makroskop je vybaven náhradním osvětlením z LED diod. Osvětlení se zapne zasunutím napájení na zadní straně makroskopovaciho stolu (druhý napájecí zdroj pro zrcadlovku je tamtéž). Dioda má nastavitelný jas, nastavení se provádí pomocí potenciometru na kablíčku položeném nad promítací deskou. K dispozici jsou LED diody různých barev které lze vyměnit. Výměnu provedeme tak že zhasneme diodu, povolíme šrouby která drží desku s chladičem a diodou, desku vysunem a na její místo zasunem novou tak aby zapadla do držáku a šrouby znovu zlehka dotáhnem (nepřetahovat). {{:equipment:2017-01-03_led_osvetleni.pdf|Výkres držáku, DXF u Pinkyho }} K dispozici jsou dve clony, dva polarizacni filtry a barevne filtry nachazejici se v soustave ihned za diodou. Pokud potrebujete jiny odstin, lze nejake dalsi barevne filtry nalezt v druhem supliku makroskopove skrine. Puvodni xenonovou lampu prosime NEPOUZIVAT pokud to pozorovani vyslovene nepozaduje. Jeji provoz vede ke generovani nezanedbatelneho mnozstvi ozonu. Podrobnejsi verze manualu: Podrobny manual k makroskopu se nachazi ve spodnim supliku makroskopove skrine v CZ a DE verzi. Priklady outputu z mikroskopu: [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=716fa4&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/omgwtfuran.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/omgwtfuran.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=7676fe&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/preslicka2.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/preslicka2.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=61f87d&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/tunika-cesneku.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/tunika-cesneku.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=14e6ad&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/interference.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/interference.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=e97344&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/vaisala-cpu-darkfield.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/vaisala-cpu-darkfield.jpg?direct&150}}]] ==== Jenamed aka Miniskop ==== vhodný pro: prusvitova mikroskopie \\ objektivy: planachromaticke, 3.2x, 6.3x, 16x, 50x, 100x [imerzni] \\ okulary: 10x \\ owner: brmlab | [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=b9d630&media=https://brmlab.cz/_media/equipment/jenamed2.jpg|{{https://brmlab.cz/_media/equipment/jenamed2.jpg?400&direct }}]] | 1 -regulace osvetleni \\ 2 - posun stolku \\ 3 - barevne filtry \\ 4 - clona - pozor dukladne schovana ;] \\ 5 - kondenzor \\ 6 - stolek \\ 7 - revolver s objektivy \\ 8 - sloty pro filtry \\ 9 - beam splitter \\ 10 - vystup pro kameru \\ 11 - okulary \\ | Kompaktni mikroskop zajimave konstrukce vhodny pro veskere biologicke prace a mikrofotografii. Ostreni najdete za stoleckem v podobe velkeho otocneho kola [chybi tedy klasicky makrosroub/mikrosroub]. Na fotografii z prave strany neni videt prehazovani kondenzoru. Objektiv se zvetsenim 16x originalne nepatri k teto soustave, u pozorovani okem to temer neni poznat, nicmene pri fotografovani neni mozne naplno zaostrit. Pokud potrebujete nutne fotit na toto zvetseni napiste sumie-dh, donese vam objektiv se zvetsenim 20x kompatibilni s touto soustavou. Zdvih stolecku ma pomerne maly rozsah, budte opatrni pri pozorovani trvalych preparatu, je snadne sklicka znicit a poskrabat tak objektivy. Dostupne moznosti pozorovani objektu: * bright field ==== Delta Optical Genetic Pro Trino ==== vhodny pro: biologicke preparaty - klasicka svetelna mikroskopie \\ objektivy: achromaticke - 4x, 10x, 20x, 40x, 100x imerzni \\ okulary : 10 x \\ owner: [[:user:sumie-dh|sumie-dh]] \\ |[[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=38d627&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/bio.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/bio.jpg?direct&500 }}]]|1 - trinokularni tubus \\ 2 - okulary \\ 3 - objektivy \\ 4 - stolek mikroskopu \\ 5 - rucicky pro fixovani sklicka \\ 6 - regulace clony \\ 7 - posuv kondenzoru vertikalne \\ 8 - posuv sklicka dopredu a do stran \\ 9 - LED dioda \\ 10 - regulace jasu osvetleni \\ 11 - on / off osvetleni \\ 12 - posuv stolku vertikalne \\ 13 - jemny posuv stolku vertikalne - jemne doostreni | Dostupne moznosti pozorovani objektu: * bright field * dark field [velmi limitovane > ugly hack stylem "posbirej co najdes a naskladej to mezi kondenzor a objektiv"] Osvetleni: * podsvit LED diodou s moznosti zacloneni * moznost pouzivat barevne filtry, aktualne je do clonoveho krouzku mozno vlozit originalni zeleny a sepiovy vypujceny z makroskopovaci sady Nejvhodnejsi kandidat pro pozorovani beznych biologickych objektu od pohyblivych potvor po histologicke preparaty. Bonus je moznost paralelniho pozorovani pres mikroskopovaci kameru nebo foceni zrcadlovkou s adapterem pro trinotubus. Mikroskop nedisponuje hornim prisvitem, tudiz se nehodi na pozorovani objektu jejichz hmotu nelze prosvitit, na tyto ukoly slouzi Makroskop a stereomikroskop. Priklady outputu z mikroskopu: [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=49685d&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/diatoms-fragilaria-sp.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/diatoms-fragilaria-sp.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=85bc19&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/protozoa-marine-euplotes.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/protozoa-marine-euplotes.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=54d885&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/chrupavka-kure2.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/chrupavka-kure2.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=39020b&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/lisejniky4.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/lisejniky4.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=f9f59c&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/charophyta-closterium.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/charophyta-closterium.jpg?direct&150}}]] ==== PZO Studar ==== vhodny pro: prusvitova mikroskopie \\ objektivy: achromaticke - 4x, 10x, 20, 40, 100x imerzni \\ okulary: 5x , 10x, 12x \\ owner: [[:user:chido|chido]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=a6ca90&media=http://used-microcopes.de/bio/PZOBIO01.jpg|{{http://used-microcopes.de/bio/PZOBIO01.jpg?direct&400}}]] Skolni binokularni mikroskop jiz zanikle polske firmy PZO s achromatickymi objektivy. Mikroskop bydli v drevene krabici na mikroskopovacim stole, prosime vracet dovnitr vcetne veskereho prislusenstvi. ==== Delta Optical Biolight 200 ==== objektivy: achromaticke 4x , 20x, 40x \\ vhodny pro: biologicke preparaty - klasicka svetelna mikroskopie \\ okulary: 10x \\ owner: brmlab [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=057522&media=http://deltaoptical.pl/upload/files/20130422_135932_157245.jpg|{{http://deltaoptical.pl/upload/files/20130422_135932_157245.jpg?direct&400}}]] Monokularni mikroskop pro biologicke ucely drobnych rozmeru. Prakticky na tahani po labu a prenaseni. ==== BrmScope ==== Made in Brmlab. Tento mikroskop ma [[http://brmlab.cz/project/brmscope?s[]=microscope|samostatnou wiki stranku]]. Aktualne ceka na refactoring. [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=58b51a&media=https://brmlab.cz/_media/project/brmscope.jpg|{{https://brmlab.cz/_media/project/brmscope.jpg?direct&400}}]] ---- ==== Zrcadlovky ==== Aktualne neni k dispozici zadny fotak. Pokud mate linuxovy OS a fotak kompatibilni s https://entangle-photo.org/ je prakticke pouzivat tuto kombinaci. Pokud nemate zadnou fototechniku, ale chcete si odnest z pozorovani nejake kvalitnejsi obrazky, chytte [[:user:sumie-dh|sumie-dh]]. Je pravdepodobne ze bude mit nekde po kapsach zrcadlovku s prislusenstvim. ==== Mobilni telefony ==== Jednoducha cesta k snadno ziskatelnym sirokouhlym jpg obrazkum. Muzete vytisknout bud [[http://www.thingiverse.com/thing:78071|univerzalni drzak]] nebo se poohlednout po repozitarich s 3D modely po specialnim pro urcity typ telefonu. Nabidka je pomerne siroka. Priklady outputu z Samsung Galaxy Note I + Delta Optical Genetic Pro Trino : [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=ccbbb1&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/krvak3.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/krvak3.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=0ea641&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/stred.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/stred.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=488a95&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/ploutvicka-100.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/ploutvicka-100.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=40db24&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/chromatofory-puzzle.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/chromatofory-puzzle.jpg?direct&150}}]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=16ea0f&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/sroubovicky.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/sroubovicky.jpg?direct&150}}]] ---- =====DEPOZIT==== Pristroje ktere jsme v brmlabu v predeslych letech meli, ale z ruznych duvodu nejsou aktualne k dispozici. Nektere lze vyzadat na konkretni projekt - napiste majiteli ;] ==== Fluoval aka Fluoroscop ==== vhodny pro: fluorescencni mikroskopie \\ objektivy: achromaticke - 4x, 10x, 20x, 40x, 100x imerzni \\ okulary : 10 x \\ owner: [[:user:sumie-dh|sumie-dh]] \\ {{https://i.ebayimg.com/images/i/322229676102-0-1/s-l1000.jpg?direct&500}} Dostupne moznosti pozorovani objektu: * bright field Specialni clen stada mikroskopu zalozeny na modularni rade Amplival. Radi jej zapujcime po dohode na konkretni zalezitosti. Se zdrojem pro lampu vazi pres dvacet kilo takze je nejprve potreba zaridit dovoz z jeho domovske staje. Zatim v testovaci fazi - neni u nas prilis dlouho. ==== USB kamera k mikroskopu 3,0Mpx ==== owner: [[:user:sumie-dh|sumie-dh]] [[https://brmlab.cz/lib/exe/fetch.php?tok=b0e2e7&media=http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/kamerka.jpg|{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/kamerka.jpg?direct&400}}]] Pro plynuly zaznam videa rychle se pohybyjiciho objektu ci ziskavani materialu pro timelapse je prakticke vyuzit USB kamerku. Pristroj se nachazi v zelenem boxu na drevene krabici mikroskopu Studar. Nejjednodussi zaznamemani se da provest pres vlc nebo gucview, oba programy maji GUI pro upravu expozice a jednoduche prostredi pro zaznam. Kamerka se nasazuje do trinokularniho tubusu nebo do okularoveho tubusu misto okularu. Priklady outputu z kamerky: {{youtube>RwQs7prdXxw?medium}} \\