[Brmlab] Biolab: PCR Primery RFC

Stevko stevko at stevko.info
Thu Sep 26 22:12:41 CEST 2013


On Thu, Sep 26, 2013 at 09:56:11PM +0200, George Blackhead wrote:
> Spis bych se na vyraz PRIMER dival z pohledu matematickeho vyznamu. Slysel jsi uz nekdy o druho-cislech a treto/treti-cislech? :-D

<troll>
Samozrejme.
http://necyklopedie.wikia.com/wiki/Druho%C4%8D%C3%ADslo
</troll>

Stevko

> 
> (Detrollification)
> 
>  
> 
> From: brmlab-bounces na brmlab.cz [mailto:brmlab-bounces na brmlab.cz] On Behalf Of cored.coder na gmail.com
> Sent: Thursday, September 26, 2013 1:38 PM
> To: Brmlab: Hackerspace Prague (main discussion)
> Subject: Re: [Brmlab] Biolab: PCR Primery RFC
> 
>  
> 
> Ahoj, mozna trochu trolovaci, ale vazne mineny dotaz:
> kdyz mame primery, jsou i secundery, tercery, ...?
> 
> sachy
> 
> 
> 
> ---------- Původní zpráva ----------
> Od: Jakub Friedl <jakub.friedl na gmail.com>
> Datum: 26. 9. 2013
> Předmět: Re: [Brmlab] Biolab: PCR Primery RFC
> 
>  
> 
>  
> 
> 2013/9/26 Petr Baudis <pasky na ucw.cz>
> 
>   Ahoj!
> 
> 
> On Thu, Sep 26, 2013 at 01:40:15AM +0200, Jakub Friedl wrote:
> > v rámci aktuálního biolab grantu je nějaká částka (přesně ví bluebear)
> > vyhrazená pro nákup primerů pro PCR.
> >
> > Bylo by fajn, aby jsme se zamysleli nad tím, jaké primery objednáme (grant
> > by se měl vyúčtovat do 3 měsíců) - a pokud není sekvence dostupná v
> > literatuře, primery navrhnout.
> 
>   Mozna by bylo dobre upresnit, k cemu jsou takove primery dobre. Sam
> tomu moc nerozumim, laicky bych to mozna rekl (doufam ze priblizne
> spravne) tak, ze primery jsou male kousky DNA, ktere se matchuji na DNA,
> kterou analyzujeme, a tak urcuji, jake casti DNA pak vizualne uvidime v
> podobe carek na elektroforeze.  Zajimaji nas tedy takove kusy DNA, ktere
> se lisi podle toho, jestli obsahuji featuru, ktera nas pri analyze
> zajima (pritomnost geneticke vady, druhovy puvod, ...) a podle toho
> musime primery vybrat.  Poradneho vysvetleni toho procesu se jiste
> dockate od chido na hackathonu v sobotu. :)
> 
>  
> 
> no ten mail byl spíš adresovát těm, co to vědí :) nevím, zda se někdo čerstvě obeznámený
> 
> s teorií pustí do plánování experimentů a grantu (tím nechci nikoho odrazovat), bych spíš čekal,
> 
> že si to nechá nejdříve předvést
> 
>  
> 
> > Pak by myslím bylo fajn mít kromě specifických primerů něco univerzálního,
> > nejspíše nějaké zavedené sekvence používané na barcoding. I když si myslím,
> > že produkt vhodný k sekvenaci se nám jen tak nepovede.
> 
>   Co je to barcoding?
> 
> s pouzitim vicemene univerzalnich primeru (navrzenych pro cele velke skupiny organismu)
> 
> a porovnanim sekvence s databazi můžeš identifikovat jinak těžko rozpoznatelné druhy
> 
>  
> 
>  
> 
>  
> 
> K
> 
> _______________________________________________
> Brmlab mailing list
> Brmlab na brmlab.cz
> http://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/brmlab
> 
> =
> 

> _______________________________________________
> Brmlab mailing list
> Brmlab na brmlab.cz
> http://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/brmlab



More information about the Brmlab mailing list