[Brmlab] Biolab: PCR Primery RFC

Petr Baudis pasky at ucw.cz
Thu Sep 26 12:30:12 CEST 2013


  Ahoj!

On Thu, Sep 26, 2013 at 01:40:15AM +0200, Jakub Friedl wrote:
> v rámci aktuálního biolab grantu je nějaká částka (přesně ví bluebear)
> vyhrazená pro nákup primerů pro PCR.
> 
> Bylo by fajn, aby jsme se zamysleli nad tím, jaké primery objednáme (grant
> by se měl vyúčtovat do 3 měsíců) - a pokud není sekvence dostupná v
> literatuře, primery navrhnout.

  Mozna by bylo dobre upresnit, k cemu jsou takove primery dobre. Sam
tomu moc nerozumim, laicky bych to mozna rekl (doufam ze priblizne
spravne) tak, ze primery jsou male kousky DNA, ktere se matchuji na DNA,
kterou analyzujeme, a tak urcuji, jake casti DNA pak vizualne uvidime v
podobe carek na elektroforeze.  Zajimaji nas tedy takove kusy DNA, ktere
se lisi podle toho, jestli obsahuji featuru, ktera nas pri analyze
zajima (pritomnost geneticke vady, druhovy puvod, ...) a podle toho
musime primery vybrat.  Poradneho vysvetleni toho procesu se jiste
dockate od chido na hackathonu v sobotu. :)

> Pak by myslím bylo fajn mít kromě specifických primerů něco univerzálního,
> nejspíše nějaké zavedené sekvence používané na barcoding. I když si myslím,
> že produkt vhodný k sekvenaci se nám jen tak nepovede.

  Co je to barcoding?

-- 
				Petr "Pasky" Baudis
	If I had more time, I would have written you a shorter
	letter.  -- Blaise Pascal


More information about the Brmlab mailing list